Tanıtılalı sadece birkaç ay olmasına rağmen sedan M3, makyaj operasyonundan nasibini aldı.
M3 sedanla tanışalı daha birkaç ay olmasına rağmen, aracın 2009 modeli şimdiden bıçak altına yattı. 2009 için stop lambaları diğer makyajlı E90'larla aynı hale getirilirken, ön tarafta herhangi bir değişikliğe gidilmedi zira M3'ün ön kısmı zaten standart 3-serisi sedandan farklı.
7-serisinden geçirilen yeni iDrive kontrollerine ek olarak, 2009 M3'te şu ana dek yalnızca diğer modellerde sunulan "Le Mans Mavisi" renk seçeneği de sunulacak.